2007年2月，张继科参加国乒“直通萨格勒布”选拔赛，以4-2战胜王皓。4月14日，在国乒“直通萨格勒布”第三轮选拔赛中，以2-4负于雷振华，失去直通世乒赛名额。5月2日，国家体育总局乒羽中心主任刘凤岩正式公布中国乒乓球队参加2007年萨格勒布世乒赛的队员名单，张继科因在比赛和训练中的良好表现，搭上通往萨格勒布的末班车。5月24日，职业生涯首次参加世乒赛，在混双项目中与姚彦搭档，第二轮比赛中负于德国组合苏斯/沃西。10月26日，参加第六届全国城市运动会乒乓球男子双打决赛，搭档周鑫，以4-2战胜许昕/尚坤中夺得冠军。